微生物菌肥价格比有机肥贵，这点农民朋友普遍都这么认为，那么它贵在哪里？与有机肥相比，到底有什么区别呢？微生物菌肥的使用方法是什么？接下来我们具体看一下。
微生物菌肥的作用：
1、将大分子的有机质、氮、磷、钾等元素，分解成可被果树直接吸收的小分子养分，高效提高有机肥和无机肥的吸收利用率。
2、利用优势菌群的霸道性，抑制病杂菌，拮抗重茬菌，提高果树的抗病能力，如同“大树底下小树长不大”的道理。
3、活化修复土壤，改良酸性土壤，提高土壤团粒结构，防治、减少烂根发生。
4、微生物繁殖分泌的天然激素，刺激根系分支发育数量和生长量，健壮树势，显著提高果树抗旱等综合抗逆性能。
5、活性土壤中的矿物质养分，促进移动性较差的磷、钙、镁、铁、锌、硼等养分的吸收，强力提高对氮、钾肥的捕获吸收能力。
微生物菌肥和有机肥有什么区别？
·有机肥
从定义上来看，有机肥是利用一切有生命的动、植物残体以及人畜排出的粪便等，直接或加工后而成的肥料，主要有堆肥、粪肥、饼肥、绿肥等，当然也包括商品有机肥。
其特点是营养全面，且具有缓效性。兼有改良土壤理化性质、提升土壤有机质等作用。
·生物菌肥
泛指含有特定的活体微生物，可通过其生命活动促进植物营养元素的供应量吸收，有的还能释放生长激素并抑制有害微生物的形成的一类肥料。主要包括固氮菌类、微生物拌种剂及复合生物菌肥三类。
有机肥与生物菌肥的区别
①侧重点不同：有机肥是一种肥料，但生物菌肥的落脚点在菌上，更偏向其功能性，如提高肥力、促进土壤中难溶的矿质营养释放、增强植物抗病抗逆能力等。
②使用方式不同：有机肥一般是作底肥、或生长期追肥；菌肥可用于拌种、基肥、追肥、蘸根等。
③使用条件不同：有机肥一般无特殊的限制条件，但菌肥是“活”的，所以不可与杀虫剂、杀菌剂混用，也不能长期暴露于阳光照射下。此外，土壤的含水量、温度、pH条件等也会影响菌肥的效果。
微生物菌肥的使用注意事项
微生物肥料对土壤条件要求比较严格，施入到土壤后，需要一个适应、生长、供养、繁殖的过程，一般15天后就可以发挥作用，见到效果，而且能长期均衡地供给作物营养。
微生物菌肥适宜施用的时间是清晨和傍晚或无雨阴天，这样可以避免阳光中的紫外线辐射将微生物杀死。
微生物菌肥应避免高温干旱条件下施用。施用微生物菌肥时要注意温度、湿度的变化，在高温干旱条件下，微生物生存和繁殖会受到影响，不能充分发挥其作用。要结合盖土浇水等措施，避免微生物菌肥受阳光直射或因水分不足而难以发挥作用。
微生物菌肥不能长期泡在水中，在水田里施用时应干湿灌溉，促进生物菌活动。以好气性微生物为主的产品，则尽量不要用在水田。严重干旱的土壤会影响微生物的生长繁殖，微生物菌肥适合的土壤含水量为50%~70%。
微生物菌肥可以单独施用，也可以与其他肥料混合搭配施用。但微生物菌肥应避免与未腐熟的农家肥混用。与未腐熟的有机肥混用，会因高温杀死微生物，影响肥效。同时也要注意避免与过酸过碱的肥料混合施用。
微生物肥料应避免与农药同时使用。化学农药都会不同程度地抑制微生物的生长和繁殖，甚至杀死微生物。不能用拌过杀虫剂、杀菌剂的工具装微生物菌肥。微生物菌肥不宜久放，拆包后要及时施用，一次用完，包装袋打开后，其他菌就可能侵入，使微生物菌群发生改变，影响其使用效果。
避免盲目施用微生物菌肥。微生物菌肥主要是提供有益的微生物群落，而不是提供矿物质营养养分，微生物肥料不能完全代替化肥。任何一种类型的微生物肥料，都有其使用的土壤条件、作物种类、耕种方式、施用方法、施用量等，只有掌握了这些技术，才能取得好的增产效果。
注意微生物菌肥效果的影响因素。微生物菌肥肥效的发挥既受其自身因素的影响，如菌肥中所含有效菌数、活性大小等质量因素；又受到外界其他因子的制约，如土壤水分、有机质、pH值等影响，因此微生物肥料从选择到应用都应注意其合理性。